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在12月28日舉行的“水專項‘十二五’實施計劃編制啟動會暨地方科技需求座談會”上，水專項管理辦公室主任、環境保護部副部長吳曉青指出，在“十二五”期間，國家水專項將加大關鍵環境技術的推廣應用，示范區擴大到流域；加強產學研用結合，培育戰略性新興產業等。
吳曉青說，“十二五”實施計劃將銜接“十一五”計劃，按照“控源減排”“減負修復”“綜合調控”三階段循序推進；在“三河、三湖、一江、一庫”等重點流域開展湖泊富營養化控制、河流和城市水環境綜合整治、飲用水安全保障等研究與示范，重點突破面源污染和有毒有害污染物控制、水體生態修復關鍵技術，將水污染防治綜合管理和控制技術體系大規模應用于重點流域和區域。
吳曉青強調，水專項將吸收企業管理和技術專家進入專項總體專家組，參與專項的“頂層設計”；選擇具有市場推廣前景或影響企業污染達標排放的關鍵技術，開展產學研合作；加大企業牽頭承擔課題比例，推動其自主創新能力的提高，培育一批具有較強自主創新能力的大型環保科技型企業，為推動環保產業發展成我國新興戰略性支柱產業提供科技支撐。
環保部門目前正組織制定“十二五”環保規劃，將在化學需氧量（COD）總量控制基礎上加強氨氮和總磷控制，并推動面源污染防治。吳曉青說：“水專項實施計劃還將與國家‘十二五’環保和飲用水安全保障規劃、重點流域水污染治理規劃緊密銜接；需在面源污染控制、脫氮除磷等關鍵技術研發方面取得突破，為‘十二五’國家環保規劃實施提供科技支撐。”
水專項管理辦公室副主任、環境保護部科技司司長趙英民說，針對“十一五”期間水專項進度緩慢、“小、散、全”、成果產出不多、標志性成果凝練不夠等問題，在2010年新啟動的“重點流域水污染控制與治理綜合決策技術研究”項目（含5個課題）和黃河中上游、重金屬污染防治等4個增補項目（課題）上，將嚴格技術把關；“重點流域水污染控制與治理綜合決策技術研究”增補項目中，將突出對當前黃河中上游、重金屬和污泥處置等重大、急迫問題的解決等。
據悉，水專項投入逾百億，是迄今為止，我國資金投入總量最大的環境科研項目。截至目前，共啟動32個項目、230個課題，占“十一五”擬啟動課題數的96.6%。
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